Ranyelson Neres Carvalho Carvalho, R. N.

Juliane Farinelli Panontin Panontin, J. F.

Isis Prado Meirelles de Castro Castro, I. P. M.

Madianita Bogo Marioti Marioti, M. B.

Walkiria Regis de Medeiros Medeiros, W. R.

Resumo

Este trabalho tem como foco possibilitar um bom desempenho na execução de cálculos para a simulação computacional da dinâmica molecular, com software Gromacs. Essas simulações têm um custo computacional elevado, de forma que é interessante utilizar equipamentos de alto desempenho para diminuir o tempo de resposta. Assim, foi construído um cluster de computadores, formado por computadores de uso geral trabalhando de forma conjunta para alcançar desempenhos similares ao de computadores de alto desempenho. Este artigo apresenta uma visão geral sobre métodos para de sistemas moleculares e clusters de computadores; a metodologia; os procedimentos realizados; e o desempenho do cluster.