O processo de tombamento do Museu de Zoologia do CEULP deu-se em consequência da construção da UHE – Luís Eduardo Magalhães, a partir da coleta de animais mortos e/ou feridos que vieram a óbito. A Instituição é responsável pela salvaguarda destes materiais, no sentido de assegurar a memória histórica, de valor patrimonial, social e científico. O museu abriga cerca de 7.413 exemplares entre a taxidermia, a conservação em meio líquido e de outras peças. Toda a coleção se encontra organizada de forma numérica, distribuída em gavetas, prateleiras, potes e tambores. O acervo tem conexão com as práticas da Educação Ambiental através da “Exposição Itinerante de Animais Taxidermizados” realizadas em escolas de ensino fundamental no município de Palmas e no Terraquarium, de visitas direcionadas e também para pesquisas científicas.